色譜是一種分離分析手段，分離是核心，因此擔負分離作用的色譜柱是色譜系統的心臟。對色譜柱的要求是柱效高、選擇性好，分析速度快等。
 

　　市售的用于HPLC的各種微粒填料如多孔硅膠以及以硅膠為基質的鍵合相、氧化鋁、有機聚合物微球(包括離子交換樹脂)、多孔碳等，其粒度一般為3,5,7,10μm等，柱效理論值可達5~16萬/米。
 

　　對于一般的分析只需5000塔板數的柱效;對于同系物分析，只要500即可;對于較難分離物質對則可采用高達2萬的柱子，因此一般10~30cm左右的柱長就能滿足復雜混合物分析的需要。
 

　　色譜柱在使用中最常見的問題就是柱壓升高，如果柱壓是在長時間使用過程中緩慢增加，屬于正常現象。但柱壓在使用過程中突然升高(系統管路堵塞及壓力傳感器故障除外)，可能的原因有如下幾點：
 

　　(1)色譜柱頭的過濾篩板堵塞或污染;
 

　　(2)色譜柱頭的填料被樣品污染;
 

　　(3)色譜柱內緩沖液中的鹽遇到高濃度的甲醇或其他有機溶劑，形成結晶析出;
 

　　(4)流動相PH值過大或過小使固定相結構破壞或溶解。
 

　　解決辦法如下：
 

　　(1)如確定是色譜柱頭的過濾篩板被污染，可以將色譜柱反方向用甲醇沖洗至正常壓力，或者卸下色譜柱頭，將其放在10%的稀硝酸內超聲清洗10分鐘，后再用純水超聲10分鐘，重新裝入色譜柱。
 

　　(2)如確定色譜柱頭的填料被污染，將柱頭螺絲卸下，挖出柱內前段被污染的填料，用相同的柱填料重新填入，仔細修復后，重新安裝上柱頭螺絲。
 

　　(3)如確定定是鹽結晶，用10%的甲醇/水沖洗色譜柱使柱內鹽全部溶解，再換高濃度甲醇。
 

　　(4)如果因PH值使用不當，很難恢復。